เมื่อปี พ.ศ. 2539 ทางจังหวัดสุพรรณบุรีได้ทำโครงการนำเสนอคณะรัฐมนตรี โดยภายหลังได้มอบหมายให้มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์เป็นมหาวิทยาลัยเจ้าของเรื่อง โดยหนึ่งในหลักสูตรที่จะเปิดการเรียนการสอน ณ วิทยาเขตสุพรรณบุรีนั้นคือหลักสูตรด้านการแพทย์ โดยที่มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ได้ทำโครงการจัดตั้งวิทยาเขตสุพรรณบุรี โดยวางแผนเปิดรับนิสิตตั้งแต่ พ.ศ. 2541 ระยะเริ่มแรกได้มีการเปิดสอนระดับปริญญาตรีในหลักสูตรสาธารณสุขศาสตรบัณฑิต หลักสูตรวิทยาศาสตรบัณฑิต สาขาวิทยาศาสตร์การกีฬา และสาขาการจัดการโรงแรมและท่องเที่ยว และปริญญาโทหลักสูตรบริหารธุรกิจมหาบัณฑิต ซึ่งต่อมาสาขาวิทยาศาสตร์การกีฬาได้ย้ายไปที่วิทยาเขตกำแพงแสน เนื่องจากประสบปัญหาด้านงบประมาณ สำหรับการเปิดสอนหลักสูตรแพทยศาสตรบัณฑิต ณ วิทยาเขตสุพรรณบุรีนั้นก็ยังไม่สามารถเปิดสอนได้ ทำได้เพียงหลักสูตรด้านธุรกิจบริการ

ปี พ.ศ. 2566 สภามหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ในคราวประชุมครั้งที่ 11/2566 เมื่อวันจันทร์ที่ 27 พฤศจิกายน 2566 ได้พิจารณาอนุมัติจัดต้งคณะสหวิทยาการจัดการและเทคโนโลยี[1] เพื่อให้โครงการจัดตั้งวิทยาเขตสุพรรณบุรีมีความชัดเจน และความคล่องตัวในการดำเนินงานอย่างเป็นรูปธรรม และสอดคล้องการรองรับการดำเนินงานจากส่วนกลางของมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ (วิทยาเขตบาเขน) และรองรับกับนโยบายการพัฒนาเศรษฐกิจตามยุทธศาสตร์ระเบียงเศณษฐกิจพิเศษภาคกลาง-ภาคตะวันตก โดยมีจังหวัดสุพรรณบุรีเป็นจังหวัดหนึ่งในพื้นที่ฐานเศษญกิจชั้นนำด้านอุตสาหกรรมเกษตร และการท่องเที่ยวเชื่อมโยงกับกรุงเทพมหานคร